Santri baru: pemetaan, wacana ideologi dan kritik
NU dan bangsa 1914-2010: pergulatan politik dan kekuasaan
Tafsir surah al ma'un: pembelaan atas kaum tertindas
Gus Dur dan Negara Pancasila
Ensiklopedi Khittah Nahdlatul Ulama
Tafsir Surah Al-Maun
Suluk dan Tarekat
Membedah Ideologi Kekerasan Wahabi
Doktrin Wahhabi dan Benih-benih Radikalisme Islam
Sejarah lengkap Wahhabi
Ensiklopedia khittah NU: sejarah pemikiran khittah NU
Suluk dan tarekat: jalan mengenal dan mendekatkan diri kepada Allah
Detik-Detik Pembongkaran Agama
Suluk dan tarekat